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Laboratorio de Biología y Microbiología

Laboratorio de Biología y Microbiología

En el laboratorio de Biología se realizan análisis de aguas superficiales y subterráneas con el fin de:

  • apoyar los programas de vigilancia de la calidad del agua por medio de métodos normalizados nacionales e internacionales y de acuerdo con la Directiva Marco de Agua (DMA 2000/60/CE) y la Directiva de Aguas Subterráneas (GWD2006/118/CE).
  • vigilar las floraciones de cianobacterias y sus toxinas en las aguas superficiales y desarrollar soluciones tecnológicas para la eliminación de las cianotoxinas en el tratamiento del agua.

Aplicaciones

  • Análisis de un gran conjunto de indicadores biológicos procedentes de:
    • Aguas superficiales: embalses, lagos, ríos
    • Aguas subterráneas  (acuíferos de interior y costeros)
    • Ecosistemas dependientes de aguas subterráneas (zona hiporreica de los ríos)
  • Identificación de especímenes de cianobacterias, ciclopoides y ostrácodos en el rango de nivel taxonómico más bajo.
  • Test de acuicultura y ecotoxicología (bioensayos, ensayos crónicos, agudos y subletales) para monitoreo biológico integrado de la calidad del agua, que permitan apoyar test bacteriológicos y fisicoquímicos.
  • Biodegradación de cianotoxinas y de diversidad de poblaciones bacterianas biodegradadoras, usando clásicos marcadores de genes y estudios de metagenómica.
  • Desarrollo de herramientas moleculares para el seguimiento de las floraciones de cianobacterias y sus toxinas en las aguas superficiales.
  • Desarrollo de una solución tecnológica para el control biológico y la eliminación de cianotoxinas en el tratamiento del agua.
  • Ensayos de toxicidad con organismos acuáticos a nivel individual, poblacional y de comunidad (usando micro-/mesocosmos).

Equipamiento

  • Unidad de Ecohidrología: la unidad microbiológica está totalmente equipada con microscopios de alta calidad óptica, disponibles con sistemas de foto-montaje de alta resolución para facilitar las identificaciones y la acuicultura de invertebrados:
    • Microscopio de luz, Olympus CX41
    • Microscopio estéreo, Olympus SZX10
    • Microscopio estéreo, Olympus SZX7
    • Microscopio estéreo, Olympus SZ51
    • Cámara de fotos digital, Olympus
    • Incubadora para invertebrados de agua subterránea
    • Acuarios para acuicultura
  • Unidad de Cianobacterias and cianotoxinas:
    • Incubadora para cultivos de cianobacterias y bacterias
    • Evaporador giratorio con sistema de refrigeración, Buchi, para la extracción de cianotoxinas
    • Equipos de extracción en fase sólida, para concentrar extractos de toxinas
  • Unidad de Biología Molecular
    • Sistema de documentación de geles, AlphaImager, para electroforesis
    • Máquina de PCR en tiempo real, AB7300, para estudios de genes cuantitativos y cualitativos
    • Nano-fotómetro, Época, para la medición de la concentración de ADN en volúmenes tan bajos como 2 l.
    • Equipo de electroforesis en gel, Biorad, para la electroforesis de ADN y ARN
    • PCR Termociclador, para llevar a cabo la reacción PCR
    • Homogeneizador para la extracción de ADN, Precellys, para extraer el ADN de las células bacterianas
  • Unidad de Tecnologías Electroquímicas Microbianas
    • 2 equipos bipotenciostatos/galvanostatos μSTAT400 de la compañía Dropsens, permiten realizar experimentos con electrodos serigrafiados de grafito y oro (Screen printed electrodes, en sus siglas en inglés) con volúmenes de muestra tan pequeños como el de una gota, permitiendo además el estudio y comparación de hasta dos electrodos de trabajo simultáneamente
    • Potenciostatos modelo NEV4 de la compañía Nanoelectra, permiten monitorizar mediante cronoamperometrías, voltametría cíclica y curvas de potencia en sistemas bioelectroquímicos de pequeño tamaño.
    • Potenciostato SP-150 de Biologic. Este equipos permite realizar técnicas de voltametría cíclica, cronoamperometría y curvas de polarización de forma rutinaria en los sistemas bioelectroquímicos. Este modelo incorpora el módulo de espectroscopia de impedancia electroquímica (EIS, en sus siglas en inglés Electrochemical Impedance Spectroscopy) para realizar el análisis y caracterización de los sistemas bioelectroquímicos en términos de circuitos eléctricos equivalentes.
    • Potenciostato NEV3 de Nanoelectra. Este equipo permite realizar técnicas de voltametría cíclica, cronoamperometría y curvas de polarización de forma rutinaria en los sistemas bioelectroquímicos
    • Potenciostato SolRayo, para aplicaciones de mayor escala y potencias mayores, tiene 5 canales independientes de hasta 2 A de corriente. 
    • Potenciostato NEV6 de Nanoelectra S.L., para aplicaciones de mayor escala y potencias mayores, dispone de 8 canales independientes de hasta 1.5 A de corriente y 20 V de diferencia de potencial entre electrodo de trabajo y contraelectrodo.
  • Equipos de campo para el muestreo ecológico de ríos, zona hiporreica y aguas subterráneas:
    • Bomba Grundfos para muestreo biológico en piezómetros
    • Bomba Bou Rouch para estudio biológico de la zona hiporreica
    • Minipiezómetros de PVC para la supervisión semi-permanente de la zona hiporreica
    • sustratos artificiales y trampas cebadas
    • Testigos de sedimentos Cobra
    • Bailers para el muestreo de pozos
    • Instrumentos de medida de calidad de agua de Hanna con sensores de temperatura, conductividad, oxígeno disuelto y pH
    • Registradores de datos de temperatura (Géminis Tinytag Explorer)
    • Indicador de contacto eléctrico
    • GPS
    • Cribas
    • Redes planctónicas para muestrear invertebrados superficiales y bentónicos (palas, dragas, caja-sacatestigos y redes de mano), así como las cianobacterias planctónicas
    • Redes planctónicas para muestreos de invertebrados de agua subterránea (red Cvetkov para pozos poco profundos y pozos de perforación)

 

PCR Termociclador, para llevar a cabo la reacción PCR Sistema de documentación de geles, AlphaImager, para electroforesis

PCR Termociclador, para llevar a cabo la reacción PCR

Sistema de documentación de geles, AlphaImager, para electroforesis
Incubadora para cultivos de cianobacterias y bacterias

Incubadora para cultivos de cianobacterias y bacterias

 

Oferta científico-tecnológica: Laboratorio de biología y microbiología